يخدم مطار الغردقة الدولي حالياً مبنيي ركاب منفصلين. تم افتتاحه في أواخر عام 2014, المحطة 1 يوفر ترحيباً واسعاً مع واجهات زجاجية وأسقف كبيرة؛ حيث يتم تشغيل جميع الرحلات الدولية ورحلات الطيران العارض من هنا. أما الرحلات الأكثر تواضعاً مبنى الركاب 2 مخصصة للرحلات الداخلية المصرية وبعض رحلات الطيران العارض إلى أوروبا الشرقية.
مبنى الركاب 1 (الرحلات الدولية والرحلات المستأجرة):
يرحب هذا المبنى الجديد بشركات الطيران المستأجرة الألمانية كوندور وتي يو آي فلاي دويتشلاند وخطوط كوريندون الجوية، بالإضافة إلى شركات الطيران التي تعمل إلى وجهات أوروبية وشرق أوسطية وآسيوية، بما في ذلك الخطوط الجوية البريطانية وإيروفلوت والخطوط الجوية التركية وخطوط بيجاسوس الجوية وخطوط إيزي جيت الجوية وترانسافيا وويز إير وويز إير وشاتل الطيران النرويجي وصن إكسبرس وطيران أستانا وطيران الجزيرة للطيران وإديلويس للطيران والخطوط الجوية السويسرية الدولية.
مبنى الركاب 2 (الرحلات الداخلية ورحلات الطيران العارض في أوروبا الشرقية):
تخدم الصالة الصغيرة رحلات مصر للطيران والنيل للطيران وطيران النيل وإير كايرو للرحلات الداخلية، بالإضافة إلى رحلات الطيران العارض من صنداير ويوروينجز إلى خطوط أوروبا الشرقية مثل براغ ووارسو وبودابست.
